標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)窺鏡監(jiān)視器清洗首先包括床頭清洗，通過各種通道或端口的清潔劑抽吸，去除可見的贓物和血液。隨后，通過額外的擦洗和沖洗通道以手工清洗鏡子。然后，應(yīng)用消毒（HLD），通常使用自動洗衣機(jī)清洗，并在垂直位置晾干以避免液體淤積。手工清洗是必要的，因?yàn)樯锬ず退槠瑫恋K消毒（HLD）正常工作。

手工清洗內(nèi)窺鏡監(jiān)視器之后，所有可見臟物被清洗，但根據(jù)至少一個(gè)快速指標(biāo)來看，82%的內(nèi)窺鏡仍然是陽性的。在200個(gè)相對光單位閾值之上的ATP升高通常出現(xiàn)在活組織檢查端口（64%）和在抽吸通道（41%）。蛋白質(zhì)和血液指標(biāo)的功效似乎微乎其微，因?yàn)榈虯TP水平的內(nèi)窺鏡中，只有2個(gè)蛋白質(zhì)指標(biāo)陽性，0個(gè)血液指標(biāo)陽性，所以這可能表明：僅僅ATP可能就足以評估清洗的有效性。

充足的內(nèi)窺鏡監(jiān)視器清洗是必要的，并且目前推薦的評估方法是目視檢查。雖然目視檢查能夠識別可能較高ATP水平的內(nèi)窺鏡，但是這項(xiàng)研究表明：盡管在手工清洗去掉所有的可見臟物之后，顯著的生物負(fù)載仍然存在，特別是那些難以視覺發(fā)現(xiàn)和清洗的地方，例如：活組織檢查端口和通道。